COOL BLUE: Biodiversity survey of low-trophic aquaculture sites in Sweden and Denmark using eDNA and video monitoring

Événement déchantillonnage Observation
Dernière version Publié par University of Gothenburg le mars 24, 2026 University of Gothenburg
Date de publication:
24 mars 2026
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

This dataset provides species occurrence records from a biodiversity survey of low-trophic aquaculture sites cultivating blue mussels (Mytilus edulis), carried out within the COOL BLUE project. Records were obtained using two complementary monitoring approaches: eDNA metabarcoding, based on water samples and Autonomous Reef Monitoring Structures (ARMS) bulk samples, and baited remote underwater video (BRUV).For the BRUV approach, the associated video data were also used to train a machine learning model to identify the recorded taxa. Further information on the methodology and procedure is available here.

Enregistrements de données

Les données de cette ressource données d'échantillonnage ont été publiées sous forme dune Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant quensemble dun ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 20 enregistrements.

1 tableurs de données dextension existent également. Un enregistrement dextension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre denregistrements dans chaque tableur de données dextension est illustré ci-dessous.

Event (noyau)
20
Occurrence 
445

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous naffiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Dalipi X, Heitzmann M, Rosengren M, Obst M, Panova M (2026). COOL BLUE: Biodiversity survey of low-trophic aquaculture sites in Sweden and Denmark using eDNA and video monitoring. Version 1.0. Samplingevent dataset. https://www.gbif.se/ipt/resource?r=coolblue_dataset&v=1.0

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est University of Gothenburg. Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède lUUID GBIF suivante : 355a2838-3a95-4118-a570-4a4658e73c2a.  University of Gothenburg publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec lapprobation du GBIF Sweden.

Mots-clé

Samplingevent; Observation; eDNA; metabarcoding; BRUV; video monitoring; aquaculture

Contacts

Xhoni Dalipi
  • Fournisseur Des Métadonnées ●
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
  • Research Assistant
Swedish University of Agricultural Sciences
Gothenburg
SE
Mats Heitzmann
  • Créateur
DE
Malin Rosengren
  • Personne De Contact
  • Project Coordinator
University of Gothenburg
Gothenburg
SE
Matthias Obst
  • Personne De Contact
  • Researcher
University of Gothenburg
Gothenburg
SE
Marina Panova
  • Personne De Contact
  • Station Manager
Tjärnö Marine Laboratory
Strömstad
SE

Couverture géographique

Sampling was conducted along the Swedish west coast, including sites in the Oresund strait.

Enveloppe géographique Sud Ouest [55,667, 11,418], Nord Est [58,297, 12,693]

Couverture taxonomique

Pas de description disponible

Kingdom Animalia
Phylum Arthropoda, Rotifera, Nemertea, Annelida, Chordata, Ctenophora, Echinodermata, Mollusca, Porifera, Nematoda, Cnidaria, Bryozoa
Class Hydrozoa, Hexapoda, Palaeonemertea, Clitellata, Polychaeta, Hexacorallia, Hoplonemertea, Bivalvia, Ascidiacea, Gastropoda, Demospongiae, Chromadorea, Eurotatoria, Thecostraca, Gymnolaemata, Copepoda, Tentaculata, Echinoidea, Scyphozoa, Ophiuroidea, Branchiopoda, Malacostraca, Asteroidea, Teleostei
Order Cardiida, Scleractinia, Amphipoda, Calanoida, Decapoda, Gadiformes, Spionida, Phlebobranchia, Monostilifera, Myida, Cheilostomatida, Chromadorida, Onychopoda, Salmoniformes, Eupercaria incertae sedis, Spatangoida, Anthoathecata, Carangiformes, Lophiiformes, Ophiacanthida, Tubificida, Lobata, Gobiiformes, Diptera, Suberitida, Mytilida, Semaeostomeae, Syngnathiformes, Beloniformes, Perciformes, Phyllodocida, Balanomorpha, Forcipulatida, Venerida, Archinemertea, Littorinimorpha, Cypriniformes, Flosculariaceae, Terebellida, Anguilliformes, Cyclopoida, Pleuronectiformes, Leptothecata, Ctenostomatida, Amphilepidida, Clupeiformes, Camarodonta, Isopoda
Family Naididae, Liparidae, Arenicolidae, Flustridae, Mytilidae, Panopeidae, Campanulariidae, Janiridae, Hesionidae, Podonidae, Carangidae, Parechinidae, Paguridae, Corynidae, Chromadoridae, Anguillidae, Carcinidae, Clausocalanidae, Cyclopteridae, Ophiotomidae, Cephalotrichidae, Lotidae, Melitidae, Temoridae, Veneridae, Trachinidae, Lophiidae, Percidae, Testudinellidae, Asteriidae, Scophthalmidae, Chironomidae, Suberitidae, Engraulidae, Spionidae, Aphroditidae, Hydrobiidae, Cardiidae, Orbiniidae, Vesiculariidae, Corophiidae, Ischyroceridae, Ulmaridae, Salmonidae, Cionidae, Centropagidae, Loveniidae, Pleuronectidae, Corymorphidae, Acartiidae, Cyprinidae, Paracalanidae, Littorinidae, Hydractiniidae, Tellinidae, Magelonidae, Pectinariidae, Mactridae, Halichondriidae, Balanidae, Oregoniidae, Gobiidae, Emplectonematidae, Pandeidae, Gammaridae, Pholidae, Idoteidae, Crangonidae, Polynoidae, Aoridae, Cottidae, Caryophylliidae, Palaemonidae, Mytilicolidae, Phyllodocidae, Labridae, Terebellidae, Polybiidae, Myidae, Bolinopsidae, Gasterosteidae, Syngnathidae, Belonidae, Gadidae, Soleidae, Rathkeidae, Nereididae, Rissoidae, Ophiopholidae

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2023-11-07 / 2024-07-26

Données sur le projet

Cool Blue Future promotes community-led regenerative ocean farming in the Baltic and North Seas through projects like COOL BLUE and COOL BLUE BALTIC. These initiatives focus on low-trophic cultivation, ecosystem restoration, and local job creation. By emphasising education, community activism and business development, they aim to transform ocean farming into a regenerative, community-driven industry.

Titre COmmunity Ocean farms and Local Business cLUstErs (COOL BLUE)
Identifiant https://doi.org/10.3030/101112747

Les personnes impliquées dans le projet:

Xhoni Dalipi
  • Processeur
Mats Heitzmann
  • Créateur
Malin Rosengren
  • Personne De Contact
Matthias Obst
  • Personne De Contact
Maria Bodin
  • Personne De Contact
Marina Panova
  • Propriétaire

Citations bibliographiques

  1. Dalipi, X., Burman, E., Germishuys, J., Anton, V., Strand, Å., & Obst, M. (2025). Object detection model for epibenthic species in low-trophic aquacultures (LTA): A case study on the Swedish west coast. Zenodo. https://doi.org/10.5281/zenodo.14713926

Métadonnées additionnelles

Remerciements
Identifiants alternatifs 355a2838-3a95-4118-a570-4a4658e73c2a
https://www.gbif.se/ipt/resource?r=coolblue_dataset