Svampar i Sverige

Occurrence Observation
Dernière version Publié par Department of Soil and Environment, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU) le mai 29, 2026 Department of Soil and Environment, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU)
Date de publication:
29 mai 2026
Licence:
CC-BY 4.0

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Description

A collection of forest soil samples collected sampling was carried out in connection with the Swedish Forest Soil Inventory during 2014–2016. Organic topsoil samples were collected in 3 m2 plots in 359 conifer-dominated forest stands distributed across the Swedish boreal biome from 60° to 68° N and from 12° to 24° E. ITS2 markers were amplified from extracted DNA using the fungal-specific primer gITS7 and a 3:1 mix of the reverse primers ITS4 and ITS4arch, with both forward and reverse primers fitted with unique 8 bp sample identification tags. Composite amplicon samples were sequenced on the RSII platform (Pacific Biosciences) by SciLifeLab NGI (Uppsala, Sweden) after the addition of sequencing adaptors by ligation. This dataset was published via the SBDI ASV portal

Enregistrements de données

Les données de cette ressource occurrence ont été publiées sous forme dune Archive Darwin Core (Darwin Core Archive ou DwC-A), le format standard pour partager des données de biodiversité en tant quensemble dun ou plusieurs tableurs de données. Le tableur de données du cœur de standard (core) contient 38 658 enregistrements.

1 tableurs de données dextension existent également. Un enregistrement dextension fournit des informations supplémentaires sur un enregistrement du cœur de standard (core). Le nombre denregistrements dans chaque tableur de données dextension est illustré ci-dessous.

Occurrence (noyau)
38658
dnaDerivedData 
38658

Cet IPT archive les données et sert donc de dépôt de données. Les données et métadonnées de la ressource sont disponibles pour téléchargement dans la section téléchargements. Le tableau des versions liste les autres versions de chaque ressource rendues disponibles de façon publique et permet de tracer les modifications apportées à la ressource au fil du temps.

Versions

Le tableau ci-dessous naffiche que les versions publiées de la ressource accessibles publiquement.

Comment citer

Les chercheurs doivent citer cette ressource comme suit:

Lindahl B, Dahlberg A, Stendahl J (2026). Svampar i Sverige. Version 1.0. Department of Soil and Environment, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU). Occurrence dataset. https://www.gbif.se/ipt/resource?r=prjna693127-its2&v=1.0

Droits

Les chercheurs doivent respecter la déclaration de droits suivante:

L’éditeur et détenteur des droits de cette ressource est Department of Soil and Environment, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU). Ce travail est sous licence Creative Commons Attribution (CC-BY) 4.0.

Enregistrement GBIF

Cette ressource a été enregistrée sur le portail GBIF, et possède lUUID GBIF suivante : e580b31b-5852-4599-a8f5-7b5b0d2883b5.  Department of Soil and Environment, Swedish University of Agricultural Sciences (SLU) publie cette ressource, et est enregistré dans le GBIF comme éditeur de données avec lapprobation du GBIF Sweden.

Mots-clé

Occurrence; Observation

Contacts

Björn Lindahl
  • Créateur ●
  • Personne De Contact
Swedish University of Agricultural Sciences
Uppsala
SE
Anders Dahlberg
  • Créateur
Swedish University of Agricultural Sciences
Uppsala
SE
Johan Stendahl
  • Créateur
Swedish University of Agricultural Sciences
Uppsala
SE
Julia Kyaschenko
  • Personne De Contact
Uppsala University
752 60 Uppsala
Sverige
SE

Couverture géographique

Sweden

Enveloppe géographique Sud Ouest [59,964, 12,273], Nord Est [68,11, 23,768]

Couverture taxonomique

N/A

Kingdom Fungi
Phylum Basidiobolomycota, Entorrhizomycota, Mucoromycota, Olpidiomycota, Ascomycota, Rozellomycota, Mortierellomycota, Glomeromycota, Basidiomycota, Chytridiomycota
Order Glomeromycetes, Rozellomycotina_cls_Incertae_sedis, Pezizomycotina_cls_Incertae_sedis, Rozellomycota_cls_Incertae_sedis, Ustilaginomycetes, Mortierellomycetes, Sordariomycetes, Chytridiomycetes, Spiculogloeomycetes, Cystobasidiomycetes, Umbelopsidomycetes, Pezizomycetes, Agaricomycetes, Microbotryomycetes, Archaeorhizomycetes, Entorrhizomycetes, Agaricostilbomycetes, Candelariomycetes, Dothideomycetes, Mucoromycotina_cls_Incertae_sedis, Basidiobolomycetes, Geminibasidiomycetes, GS25, Saccharomycetes, Orbiliomycetes, Tritirachiomycetes, Rhizophydiomycetes, Pucciniomycetes, Leotiomycetes, GS27, GS18, Lecanoromycetes, Endogonomycetes, Dacrymycetes, Spizellomycetes, Ascomycota_cls_Incertae_sedis, Geoglossomycetes, Eurotiomycetes, Mucoromycetes, Tremellomycetes

Couverture temporelle

Date de début / Date de fin 2014-07-07 / 2016-09-01

Citations bibliographiques

  1. Kyaschenko, J., Tångrot, J., Dahlberg, A., Lindahl, B.D. & Rosling, A., 2026. Consistent species richness patterns but not richness estimates based on both ASV and OTU inference methods on ITS2-based soil fungal communities. Environmental DNA, 8(1) 10.1002/edn3.70246
  2. Lindahl, B.D., Kyaschenko, J., Varenius, K., Clemmensen, K.E., Dahlberg, A., Karltun, E. and Stendahl, J. (2021), A group of ectomycorrhizal fungi restricts organic matter accumulation in boreal forest. Ecol Lett, 24: 1341-1351. 10.1111/ele.13746